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段木基质变质主要是装袋时气温较高，装袋后放置时间过长，没有及时灭菌；料袋灭菌时升温时间过长；段木基质水份含量过大，均可造成段木基质变性发酸等。塑料袋质量差塑料袋太薄（0.035mm以下），质量差,段木块毛刺多，装袋、接种及运输过程中未轻拿轻放或机械破损，致使菌袋出现孔，造成污染。 罩膜初鼓起时，未放冷气；袋破或底层袋泡水或扎口太松造成水袋；常压灭菌保持时间不够、温度不够或中间加水降至100弋以下时间太长；罩膜漏气，温度达不到要求值。接种时料温太高接种时料袋温度太高，超过菌种所能承受的温度范围，造成菌种被烫伤或烫死后不萌发并感染杂菌。培菌环境不良主要是培养室内湿度过大，通风不良，环境不洁，甚至有鼠害。个别芝农在培养室内洒水并使地面上存有积水，空气相对湿度超过70％，利于杂菌滋生。
免疫调节作用灵芝抱子在传统中药中用来调节免疫系统已有较长历史.Pan等閔观察灵芝抱子多糖对甲基硝基亚硝基胍（MNNG）诱发胃癌大鼠的免疫性和抗氧化活性的影响发现，给予患胃癌大鼠灵芝抱子多糖后，可以降低血清和胃组织中脂质过氧化产物水平，并使胃癌所致的血清SOD、CAT和GSH-Px水平趋于正常，表明灵芝抱子多糖具有一定的免疫调节作用和抗氧化作用.实验发现，灵芝抱子可以提高ConA诱导的小鼠淋巴细胞转化能力，增强SR-BC诱导的小鼠足肿胀，增加溶血空班数等，表明灵芝抱子主要通过作用于免疫细胞增强其活性，从而直接或间接调节机体免疫功能. 抗氧化作用灵芝的抗氧化作用与多糖有关，并与多糖的单糖组成、分子量有较大关系.Heleno等28在对灵芝不同部位多糖的提取中发现，灵芝菌丝体中提取的多糖含量，灵芝抱子中提取的多糖抗氧化活性，其DPPH率为0.15mg/mL,还原能力为0.69mg/mL，均比其他部位提取的多糖抗氧化能力强.Deepalakshmi 实验发现灵芝抱子的乙醇提取物表现出强烈的抗氧化活性，其体外抗氧化活性显示，灵芝抱子的乙醇提取物对ABST、DPPH、OH-、O2－的体外能力均较抗坏血酸低，但相差不大.
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